O peixe-boi marinho (Trichechus manatus manatus) é um pacato mamífero aquático que pertence a ordem Sirenia. A caça indiscriminada da espécie no passado diminuiu consideravelmente o número de indivíduos, o que potencializou a extinção da espécie em águas brasileiras. Esses animais habitam preferencialmente águas costeiras, e utilizam os estuários como refúgios para descanso, alimentação e reprodução. Os motivos que fazem os peixes bois utilizarem os estuários é conhecido, no entanto, ainda não existem estudos que busquem entender os fatores ambientais que influenciam na seleção dos estuários que são habitados por eles. Por essa razão, esse estudo tem por objetivo identificar através de análises estatísticas características ambientais em estuários brasileiros que influenciam na ocorrência da espécie. Espera-se que, com a elucidação dessas questões, contribuir com informações que auxiliem na elaboração de estratégias mais amplas de conservação direcionadas ao peixe-boi marinho e a esse ecossistema tão importante para a espécie.