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Banca de QUALIFICAÇÃO: MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS
DATA: 25/05/2016
HORA: 08:00
LOCAL: NUPCelt/UFPI/Teresina
TÍTULO:

Diversidade genética e estrutura populacional da lagosta (Panulirus echinatus, Smith, 1869) por meio de marcadores moleculares.


PALAVRAS-CHAVES:

Genoma mitocondrial, microssatélites, Next Generation Sequencing, Panulirus.


PÁGINAS: 104
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO:

Esse trabalho teve por objetivo o sequenciamento do genoma da lagosta (Panulirus echinatus, Smith, 1869) utilizando a tecnologia Next Generation Sequencing (NSG), visando o desenvolvimento de marcadores microssatélites, além da montagem do genoma mitocondrial da espécie. O DNA alvo utilizado para o sequenciamento foi extraído do tecido muscular da lagosta, 1 ng desse DNA foi utilizado para obtenção dos reads que foram submetidos a posterior sequenciamento, uma biblioteca de extremidades emparelhadas da Illumina foi criada conforme especificações do kit de preparação da Illumina Nextera (Illumina Inc.). O sequenciamento foi conduzido usando o sequenciador Miseq Benchtop (Illumina Inc.). As sequências contíguas (contigs) foram criadas a partir dos dados das sequências emparelhados pelas extremidades obtidas por meio do CLC Genomics Workbench 7.0.4 (Qiagen), após o sequenciamento obteve-se uma plataforma com 7196 contigs, os motifs de microssatélites foram identificados e localizados utilizando o software MSDB, foram realizadas buscas por regiões microssatélites e 27 pares de locos SSRs tri e tetranucleotídicos foram selecionados. O genoma mitocondrial foi completamente montado por interações no software MITObim. Os resultados obtidos, após o sequenciamento foi uma plataforma com 7196 contigs, onde 2959 SSR foram identificados, os mononucleotíos foi o tipo mais abundante 43,60%, seguido de dinucleotídeos (43,26%), trinucleotídeos (7,47%), tetranucleotideos (3,61%), pentanucleotídeos (1,49%) e hexanucleotideos (0,57%), dos 27 primers selecionados, 17 apresentarem polimorfismo e 3 foram monomórficos. O genoma mitocondrial completo da lagosta P. echinatus é de 15.808 pb, contendo 13 genes codificadores de proteínas, 22 RNAs de transferência e 2 RNAs ribossomais, a ordem dos genes é exatamente a mesma observada para outros mitogenomas do gênero Panulirus. Os dados fornecidos podem ajudar a esclarecer as relações evolutivas dentro da família Palinuridae, e ser usados para estudos de genética de populações e identificação de organismos em crustáceos.


MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1716862 - ADALBERTO SOCORRO DA SILVA
Externo ao Programa - 1342714 - ANGELA CELIS DE ALMEIDA LOPES
Interno - 423287 - JOSE RIBEIRO DOS SANTOS JUNIOR
Notícia cadastrada em: 13/05/2016 16:59
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