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Banca de DEFESA: SULIMARY OLIVEIRA GOMES

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: SULIMARY OLIVEIRA GOMES
DATA: 08/06/2016
HORA: 09:00
LOCAL: Sala 01 do NupCelt
TÍTULO:

Caracterização genômica e genética do caranguejo Cardisoma guanhumi (Crustacea, Decapoda, Brachyura)


PALAVRAS-CHAVES:

conservação, Gecarcinidae, microssatélites, sequenciamento.


PÁGINAS: 66
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
RESUMO:

O caranguejo guaiamum, Cardisoma guanhumi Latreille (Decapoda: Gecarcinidae) possui ampla distribuição na região neotropical, é um recurso pesqueiro bastante apreciado na gastronomia, sua comercialização tornou-se cada vez mais frequente, ocasionando preocupação devido à sobrepesca. Neste estudo, foi realizado o sequenciamento do genoma do C. guanhumi para o desenvolvimento de ferramentas moleculares, os microssatélites (SSR), visando estudo de diversidade e de estrutura populacional, além disso, foi feito a organização do genoma mitocondrial (mitogenoma) utilizando o software MIRA e MITObim. Uma biblioteca Illumina paired-end foi criada seguindo o protocolo padrão da Illumina Nextera DNA Kit Preparação de Amostras e em seguida as amostras foram sequenciadas por meio de um MiSeq Benchtop. As sequências contíguas (contigs) foram submetidas ao desenho de primers, dos 101.274 contigs observados, 136 foram passíveis de desenho. No total foi possível obter 26 pares de primers, obtendo-se 11 loci polimórficos. A validação dos novos primers foi dada pela analise de diversidade genética em populações da Flórida (n=25) e de Porto Rico (n=25). Como resultado, foi verificada a presença de diversidade genética dentro das populações, assim como a diferenciação genética. O número de alelos por loco variou entre dois (Cgua15796) e 13 (Cgua61432). A heterozigosidade esperada (He) foi de 0,248 a 0,837 (média 0,653), heterozigosidade observada (Ho) variou de 0,045 a 0,739 (média 0,293) essas analises demostram que houve diversidade genética. O PIC=0,597 obteve variação de 0,215 a 0,805. Um alto nível de diferenciação FST = 0,32 foi estimado para as populações. As analises de PCA e de estruturação (STRUCTURE) verificaram presença de dois grupos distintos. O mitogenoma foi montado, de maneira parcial, porém para a espécie, esse resultado é algo inovador. Em conclusão, os novos pares de microssatélites apresentados neste estudo demostraram ser úteis em estudo populacional para a espécie, adicionalmente, o uso de ferramentas moleculares em C. guanhumi tende colaborar com a conservação.


MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1716862 - ADALBERTO SOCORRO DA SILVA
Externo ao Programa - 1342714 - ANGELA CELIS DE ALMEIDA LOPES
Presidente - 247.195.523-15 - FABIO MENDONCA DINIZ - EMBRAPA
Interno - 423287 - JOSE RIBEIRO DOS SANTOS JUNIOR
Externo ao Programa - 068.464.242-53 - PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA - EMBRAPA
Externo ao Programa - 423361 - REGINA LUCIA FERREIRA GOMES
Notícia cadastrada em: 27/05/2016 18:10
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