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Banca de QUALIFICAÇÃO: ISIS GOMES DE BRITO SOUZA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ISIS GOMES DE BRITO SOUZA
DATA: 13/06/2016
HORA: 14:00
LOCAL: NUPCelt/UFPI/Teresina
TÍTULO:

Diversidade genética e estrutura populacional da abelha jandaíra (Melipona subnitida Ducke) por meio de marcadores moleculares.


PALAVRAS-CHAVES:

microssatélites, mitogenoma, sequenciamento


PÁGINAS: 104
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO:

A abelha Melipona subnitida (conhecida por jandaíra) possui grande importância econômica e ecológica em sua área de ocorrência. No entanto, já apresenta problemas relacionados à sua população pois colônias silvestres vem sendo reduzidas consideravelmente afetando de forma direta sua estrutura genética populacional pela eliminação de genótipos. Ferramentas moleculares vem auxiliando trabalhos de conservação por acessar diretamente ao nível de DNA a variabilidade genética das espécies. Dessa forma, o trabalho aqui descrito teve por objetivo o sequenciamento do genoma da M. subnitida para o desenvolvimento de marcadores microssatélites visando o estudo da diversidade genética e estrutura populacional da espécie, além da montagem do genoma mitocondrial para o futuro desenvolvimento de marcadores e aplicação em estudos genéticos e investigações das relações filogenéticas entre as diferentes espécies do gênero Melipona. Uma biblioteca Illumina paired-end foi criada seguindo o protocolo padrão do Kit Illumina Nextera Preparação de Amostras de DNA e em seguida as amostras foram sequenciadas por meio de um MiSeq Benchtop. As sequências contíguas (contigs) foram montadas de novo a partir das sequências paired-end resultantes usando o software CLC Genomics Workbench 7.0.4. Os contigs no formato FASTA foram submetidos ao software Msatcommander para a busca de possíveis repetições. Optou-se por examinar apenas os locos trinucleotídeos e tetranucleotídeos. Cem locos foram adequados para o desenho de primers e destes, 52 foram escolhidos para testes adicionais. O genoma mitocondrial (mitogenoma) foi quase completamente montado por abordagens in silico usando corridas iterativas de software MIRA e MITObim. Como resultados, foram identificados 5.574 locos de microssatélites perfeitos, sendo os dinucleotídeos a classe mais abundante com 89,7% do total, seguido de trinucleotídeos (6,4%), tetranucleotídeos (2,7%), pentanucleotídeos (0,7%) e hexanucleotídeos (0,5%). 23 locos de microssatélites foram isolados e caracterizados onde 17 apresentaram polimorfismos e seis foram monomórficos. Sobre o mitogenoma parcial da M. subnitida, o mesmo contém 12.740 pares de bases de comprimento. Os genes encontrados conservam a estrutura esperada na maioria dos invertebrados. Estrutura do genoma, a ordem dos genes e orientação foi semelhante às mitocôndrias descritas anteriormente para as abelhasMelipona.


MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1716862 - ADALBERTO SOCORRO DA SILVA
Interno - 2549060 - CARLA EIRAS
Externo à Instituição - PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA - EMBRAPA
Notícia cadastrada em: 31/05/2016 13:13
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