Embora os processos históricos e evolutivos tenham sido pouco abordados nos estudos ecológicos, a crescente disponibilidade de ferramentas filogenéticas tem possibilitado estudos mais robustos sobre a atuação desses na estruturação de comunidades naturais. A presente dissertação tem como propósito analisar os padrões de diversidade filogenética (PD) e estrutura filogenética de duas áreas distintas localizadas em uma região de ecótono de Cerrado e Caatinga no estado do Piauí. Com o intuito de facilitar a apresentação, a dissertação foi dividida em dois capítulos. No primeiro capítulo, intitulado “Diversidade e estrutura filogenética após o manejo agrícola tradicional de cultivo itinerante no cerrado”, estabelecemos as seguintes hipóteses: (i) A PD das vegetações em áreas de 18 e 35 anos de pousio seja semelhante à PD do cerrado de referência, uma vez que a camada lenhosa do cerrado se reestabelece rapidamente frente ao manejo que não envolve a aração do solo; (ii) A estrutura filogenética será superdispersa no início da regeneração e predominantemente aleatória nas fases intermediárias e finais, em função da rebrota de espécies filogeneticamente distantes no início da regeneração e da maior influência do banco e da chuva de sementes nas fases posteriores; (iii) Alta rotatividade filogenética entre os tempos em regeneração, retratando a chegada de linhagens tardias via dispersão ou contribuição do banco de sementes; (iv) O longo período de pousio terá favorecido a restauração das condições edáficas nas áreas em regeneração, reduzindo as restrições ambientais e exercendo pouca ou nenhuma influência na PD e estrutura filogenética. Como resultado, descobrimos que o manejo tradicional de cultivo itinerante não afeta a diversidade e a estrutura filogenética da comunidade lenhosa do Cerrado. As comunidades em diferentes tempos em pousio (18 e 35 anos) foram semelhantes ao Cerrado de referência em termos de diversidade filogenética padronizada (ses.PD). As medidas de diversidade beta filogenética apontaram que as comunidades compartilham um conjunto similar de linhagens, e a estrutura filogenética indicou um processo de regeneração controlado por fatores aleatórios, como potencial de rebrote das espécies e/ou dispersão. Além disso, o manejo agrícola ocorrido não deixou legados negativos nos atributos do solo, de modo que influenciasse os padrões de diversidade e estrutura filogenética da vegetação. Esses resultados sugerem que esse modelo agrícola deve ser incentivado quando realizado utilizando ferramentas de baixo insumo e períodos de descanso da terra mais longos. No segundo capítulo, intitulado “Influência de palmeiras na diversidade filogenética da vegetação lenhosa dos murundus em ecótono cerrado-caatinga”, testamos as seguintes hipóteses: (i) Maior PD será encontrada em murundus com presença de palmeiras, uma vez que elas se comportam como poleiros naturais que recrutam diásporos e atuam como berçários que melhoram as condições ambientais para colonização de espécies com linhagens filogenéticas distantes; (ii) A estrutura filogenética de murundus com presença de palmeiras será superdispersa, pois a facilitação atua na organização da comunidade recrutando espécies de linhagens filogenéticas distintas; (iii) Murundus com presença de palmeiras apresentam composição filogenética distinta de murundus sem palmeiras, sendo essa diferença de composição melhor explicada pela substituição e não pela distância entre os murundus. Isso é esperado porque as palmeiras, além de proporcionarem condições favoráveis para o estabelecimento de espécies, também recrutam conjuntos de linhagens distintos dos murundus em que elas estão ausentes. (iv) Murundus maiores suportam maior PD, de acordo com a teoria da biogeografia de ilhas. Mostramos que murundus com palmeiras apresentaram maior PD e uma estrutura filogenética superdispersa, provavelmente devido a um efeito facilitador. Evidenciamos diferenças de composição entre os murundus, sendo a substituição de linhagens o principal fator para a diferença entre os murundus. O efeito da distância não foi relevante, e a área influenciou a PD, corroborando a teoria da biogeografia de ilhas.