O PPGAnt é sustentado pelos seguintes núcleos e grupos de pesquisa, aos quais os docentes e discentes do Programa estão associados:
Núcleo de Estudos da Contemporaneidade (NEC) e o Laboratório de Investigação Social (LIS);
Núcleo de Pesquisas e Estudos sobre a Criança e o Adolescente (NUPEC);
Grupo de Pesquisa sobre Identidades Coletivas, Conhecimentos Tradicionais e Processos de Territorialização.
Grupo de Pesquisa em Antropologia, Diversidade, Interculturalidade e Educação (GPADIE)
- Coordenador pelo Prof. Dr. Raimundo Nonato Ferreira do Nascimento.
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